„Sztochasztikus folyamatok '12” változatai közötti eltérés

Innen: TételWiki
 
(6 közbenső módosítás, amit 3 másik szerkesztő végzett, nincs mutatva)
2. sor: 2. sor:
  
 
== Kauffman-hálózat ==
 
== Kauffman-hálózat ==
Egyes a természetben előforduló folyamat-hálózatoknak a modellezésére egy igen végletekig egyszerűsített megközelítés is hasznos kiindulási pontot szolgáltathat. A Kauffman-hálózat (vagy más néven [http://en.wikipedia.org/wiki/Boolean_network Boolean-hálózat]) nem más, mint egy gráf, melyben irányított élek vannak, és a csomópontokban csak két féle érték engedett meg (pl. 0 - 1 v. +1 - -1). A csomópontokban ezeken a bináris értékeken értelmezett függvények vannak, amelyek minden időlépésben a befutó élek által összekapcsolt csomópontok értékeiből (és esetleg az aktuálisból) előállítanak egy előre meghatározott szabály szerint egy új értéket, és azt beírják az aktuális csomópontba. A rendszert diszkrét időlépésekben fejlesztjük.
+
Egyes a természetben előforduló folyamat-hálózatoknak a modellezésére egy igen végletekig egyszerűsített megközelítés is hasznos kiindulási pontot szolgáltathat. A Kauffman-hálózat (vagy más néven [http://en.wikipedia.org/wiki/Boolean_network Boolean-hálózat]) nem más, mint egy gráf, melyben irányított élek vannak, és a csomópontokban csak két féle érték engedett meg (pl. 0/1 vagy +1/-1). A csomópontokban ezeken a bináris értékeken értelmezett függvények vannak, amelyek minden időlépésben a befutó élek által összekapcsolt csomópontok értékeiből (és esetleg az aktuálisból) előállítanak egy előre meghatározott szabály szerint egy új értéket, és azt beírják az aktuális csomópontba. A rendszert diszkrét időlépésekben fejlesztjük.
  
 
Kauffman először az élőlények genetikai tartalmának kifejeződését vizsgálta a sejtek különböző differenciáltságán: a különböző funkciójú sejtek a különböző gének működésének hatására alakulnak ki, Kauffman modelljében ezeknek a gráfdinamika határciklusai felelnek meg. Később az ilyen alapú modellek számos más bonyolult, az élőlényekkel kapcsolatos problémában sikerrel kerültek alkalmazásra, egyetlen másik példát hozva a neurális hálózatok egyszerűbb, könyebben kezelhető modelljei is ilyen alapúak.
 
Kauffman először az élőlények genetikai tartalmának kifejeződését vizsgálta a sejtek különböző differenciáltságán: a különböző funkciójú sejtek a különböző gének működésének hatására alakulnak ki, Kauffman modelljében ezeknek a gráfdinamika határciklusai felelnek meg. Később az ilyen alapú modellek számos más bonyolult, az élőlényekkel kapcsolatos problémában sikerrel kerültek alkalmazásra, egyetlen másik példát hozva a neurális hálózatok egyszerűbb, könyebben kezelhető modelljei is ilyen alapúak.
21. sor: 21. sor:
  
 
Hamming távolság: <math> D(t)= \sum_{i=1}^N (\sigma_i(t)-\hat{\sigma_i}(t))^2 </math>
 
Hamming távolság: <math> D(t)= \sum_{i=1}^N (\sigma_i(t)-\hat{\sigma_i}(t))^2 </math>
 +
 
Normált Hamming távolság: <math> a(t)=1-\frac{D(t)}{N} </math>.  
 
Normált Hamming távolság: <math> a(t)=1-\frac{D(t)}{N} </math>.  
 +
 
Ha <math> lim_{t \rightarrow \infty } a(t) \rightarrow 1 </math> információvesztés történik, nem nyerhető vissza a kezdőállapot, ha kisebb mint 1, a rendszer "emlékszik", hogy a két különböző kezdeti állapot eltér.  
 
Ha <math> lim_{t \rightarrow \infty } a(t) \rightarrow 1 </math> információvesztés történik, nem nyerhető vissza a kezdőállapot, ha kisebb mint 1, a rendszer "emlékszik", hogy a két különböző kezdeti állapot eltér.  
  
 
Két egymás közeléből indított trajektória távolsága: <math> D(t)\simeq D(0) e^{\lambda t} </math>, ahol <math>\lambda </math> a Lyapunov exponens. Ha <math> \lambda > 0 </math> a rendszer kaotikus, ha kisebb mint 0, befagyott, ha 0, kritikus állapotban.  
 
Két egymás közeléből indított trajektória távolsága: <math> D(t)\simeq D(0) e^{\lambda t} </math>, ahol <math>\lambda </math> a Lyapunov exponens. Ha <math> \lambda > 0 </math> a rendszer kaotikus, ha kisebb mint 0, befagyott, ha 0, kritikus állapotban.  
 +
 
N(csúcsok száma)-K(kontroll elemek, bejövő élek száma egy csúcsban) modellben <math>D(t+1)=\frac{K}{2}D(t)</math>, így <math> D(t)=\left( \frac{K}{2} \right) ^t D(0)=D(0)e^{t ln(K/2)} </math>. Így K > 2 állapot kaotikus, K < 2 befagyott, és K=2 kritikus.
 
N(csúcsok száma)-K(kontroll elemek, bejövő élek száma egy csúcsban) modellben <math>D(t+1)=\frac{K}{2}D(t)</math>, így <math> D(t)=\left( \frac{K}{2} \right) ^t D(0)=D(0)e^{t ln(K/2)} </math>. Így K > 2 állapot kaotikus, K < 2 befagyott, és K=2 kritikus.
 
  
 
== Spinüvegek ==
 
== Spinüvegek ==
32. sor: 34. sor:
  
 
A spinüvegekben hasonló frusztrációk vannak, rendezetlen rácson. Úgy lehet elképzelni, hogy a spinek véletlenszerű helyeken, véletlenszerű (ferro- vagy antiferromágneses) kölcsönhatásokkal vannak összekötve. Ennek eredményeképpen a külső térre adott válaszuk igen bonyolult, számos különböző időskálán zajlik. A leírásuk is igen nehézkes.
 
A spinüvegekben hasonló frusztrációk vannak, rendezetlen rácson. Úgy lehet elképzelni, hogy a spinek véletlenszerű helyeken, véletlenszerű (ferro- vagy antiferromágneses) kölcsönhatásokkal vannak összekötve. Ennek eredményeképpen a külső térre adott válaszuk igen bonyolult, számos különböző időskálán zajlik. A leírásuk is igen nehézkes.
 +
Az egyetlen anailitikus megoldással rendelkező modellben (Sherrington-Kirkpatrick) a spinek között a szokásos Hamilton írja le a kölcsönhatást:
  
Egy konkrét gyakran használt modellben, a Sherrington-Kirkpatrick modellben a spinek között a szokásos Hamilton írja le a kölcsönhatást:
+
:<math>\mathcal{H} = -\sum_{i\ne j} J_{ij}S_i S_j - \sum_{i}h_iS_i</math>
 
 
:<math>\mathcal{H} = -\frac{1}{2}\sum_{i\ne j} J_{ij}S_i S_j</math>
 
  
de <math>J</math> egy véletlen valószínűségi változó Gauss-eloszlással. Ebben az esetben az átlagos szabadenergia kiszámolható a rendszerre zárt alakban, két fizikailag értelems paraméterrel kifejezve: az egyik paraméter eredő mágnesezettség jellegű, a másik a mágnesezettség szórását jellemzi. A spinüveg helyzetnek az felel meg, amikor az eredő mágnesezettség eltűnik, de a szórás véges, szemben például a ferromágneses renddel, ahol az eredő mágnesezettség nem zérus.
+
de <math>J_{ij}</math> egy véletlen valószínűségi változó Gauss-eloszlással, <math>h_i</math> pedig az adott spinre kapcsolt külső tér. Ebben az esetben az átlagos szabadenergia kiszámolható a rendszerre zárt alakban, két fizikailag értelems paraméterrel kifejezve: az egyik paraméter eredő mágnesezettség jellegű, a másik a mágnesezettség szórását jellemzi. A spinüveg helyzetnek az felel meg, amikor az eredő mágnesezettség eltűnik, de a szórás véges, szemben például a ferromágneses renddel, ahol az eredő mágnesezettség nem zérus.
  
 
A fázisteret két paraméterrel lehet felmérni: a csatolás relatív szórásával (a fenti Gauss szórása osztva az átlaggal) valamint a csatolás szórásának és a hőmérsékleti energiának (kT) az arányával. Ezen a diagrammon a spinüveg fázis akkor jön létre, amikor a csatolás erősebb a hőmérsékleti fluktuációknál, de a relatív szórása nagy (Megyjegyzés: az ábra vízszintes tengelyén a relatív szórás reciproka van: az átlag osztva a szórással).
 
A fázisteret két paraméterrel lehet felmérni: a csatolás relatív szórásával (a fenti Gauss szórása osztva az átlaggal) valamint a csatolás szórásának és a hőmérsékleti energiának (kT) az arányával. Ezen a diagrammon a spinüveg fázis akkor jön létre, amikor a csatolás erősebb a hőmérsékleti fluktuációknál, de a relatív szórása nagy (Megyjegyzés: az ábra vízszintes tengelyén a relatív szórás reciproka van: az átlag osztva a szórással).
  
 
[[Fájl:SpinGlass.PNG]]
 
[[Fájl:SpinGlass.PNG]]
 +
 +
A rendszerben megfigyelhető egy másodrendű fázisátalakulás a <math>T_c(H=0)</math>-ban, valamint minden alacsonyabb hőmérséklethez is tartozik egy olyan <math>H\neq0</math> mágneses tér, amelynél a spiüveg fázisból átlépünk az antiferromágneses fázisba. Ezt a <math>H-T</math> térblei vonalat nevezzük Almeida-Thouless vonalnak.
 +
 +
A rendszer érdekessége hogy fázistere erősen "göcsörtös", a spinüveg fázisban az alapállapotok és az alacsonyan fekvő gerjesztett állapotok degeneráltsága magas, így sok különálló fázistérbeli völgy alakul ki. Ennek következtében a kezdőfeltételekben, a külső térben, vagy a hőmérsékletben bekövetkezett infinitezimális változás is eltérő fázistérbeli trajektóriákhoz vezethet (nolám káosz). Bár a hőmérsékleti káoszt még vitatja a szakirodalom.
 +
 +
[[Fájl:PhaseSpace.jpg]]
  
 
== Markov-lánc, Markov-folyamatok ==
 
== Markov-lánc, Markov-folyamatok ==

A lap jelenlegi, 2012. június 15., 14:36-kori változata

Az alábbiakban néhány véletlenszerű folyamatot és ezek leírási módszereit tárgyaljuk.

Kauffman-hálózat

Egyes a természetben előforduló folyamat-hálózatoknak a modellezésére egy igen végletekig egyszerűsített megközelítés is hasznos kiindulási pontot szolgáltathat. A Kauffman-hálózat (vagy más néven Boolean-hálózat) nem más, mint egy gráf, melyben irányított élek vannak, és a csomópontokban csak két féle érték engedett meg (pl. 0/1 vagy +1/-1). A csomópontokban ezeken a bináris értékeken értelmezett függvények vannak, amelyek minden időlépésben a befutó élek által összekapcsolt csomópontok értékeiből (és esetleg az aktuálisból) előállítanak egy előre meghatározott szabály szerint egy új értéket, és azt beírják az aktuális csomópontba. A rendszert diszkrét időlépésekben fejlesztjük.

Kauffman először az élőlények genetikai tartalmának kifejeződését vizsgálta a sejtek különböző differenciáltságán: a különböző funkciójú sejtek a különböző gének működésének hatására alakulnak ki, Kauffman modelljében ezeknek a gráfdinamika határciklusai felelnek meg. Később az ilyen alapú modellek számos más bonyolult, az élőlényekkel kapcsolatos problémában sikerrel kerültek alkalmazásra, egyetlen másik példát hozva a neurális hálózatok egyszerűbb, könyebben kezelhető modelljei is ilyen alapúak.


Ez a modell számos érdekes folyamatot mutat: vannak kaotikus és reguláris mintázatok is benne. A rendszer azért sztochasztikus, mert a gráfban a kapcsolatokat és a csúcsokhoz rendelt időléptetési függvényeket véletlenszerűen osztjuk ki. Ilyen függvények tipikusan az egyszerű logikai függvényke lehetnek: OR, XOR, AND, vagy véletlenszerű, stb...

Ha N csomópont van a gráfban, akkor a rendszer állapottere 2^N, ezért az időfejlődésben legfeljebb ennyi különböző helyzetben lehet a rendszer, igen gyakran azonban rövidebb ciklusok is előfordulnak, illetve léteznek fixpont atraktorok, amik több különböző kiindulási értékből/kiotszásból is ugyanabba a helyzetbe, vagy ciklusba vezetik a rendszert.

Egy ilyen egyszerűsített modellben nyilván nem a rendszer különböző állapotainak van lényegi jelentése, hanem a változásokra adott válaszainak, a robosztusságnak (hibatűrés, külső hatások kivédése), közeli állapotokból való szétfejlődés sebessége. Ha a rendszer állapotai között bevezetjük a Hamming-távolságot, ami a különböző állapotú elemek számát jelöli, akkor van egy mérőszámunk, amivel az információ vesztést, vagy akár egy skalárisszorzat jellegű mennyiséget is definiálhatunk. Ez utóbbinak a hosszú idejű határértéke rendparaméterként váalsztja el a kaotikus és a rendezett viselkedésű rendszer állapotokat. Ezt a kritikus pontot is hatvány függvények jellemzik számos válasz függvény viselkedésében, például az attraktorok számában, vagy az átlagos határciklus-hosszban.

Példaként, a határciklus-hossz egy fontos, a valóságban is meghatározható mennyiség lehet: ha ez túl nagy, akkor az élőlény életideje alatt nem alaulhatnak ki a megfelelő stabil dinamikai struktúrák (Kauffman esetében a különböző differenciáltságú sejtek): éppen ez a helyzet a kaotikus tartományban. A másik végletként a túlságosan fix (befagyott) állapot sem jó, ugyanis nem tudja biztosítani az evolúcióshoz szükséges változóképességet. Ezért Kauffmann azt a javaslatot tette, hogy az élő rendszerek valójában a káosz szélén működnek, azaz profitálnka bizonyos mértékben a stabilitásból és a változékonyságból is.

Konkrétan az élesztő sejt osztódásának Kauffman-modellje teljesen jól adja vissza a gének és a fehérjék aktiválódási sorrendjét összevetve a kísérletekkel, hasonló összekötöttséget és kritikus közeli paramétereket reprodukálva.


Tehát bináris hálózat: véletlen irányított gráf -> kontroll elemek; csúcsokhoz véletlen bináris függvény; léptetés szinkron vagy aszinkron; minden lépésben a rendszer a 2^N dimenziós fázistér egy pontjában.

Hamming távolság:  D(t)= \sum_{i=1}^N (\sigma_i(t)-\hat{\sigma_i}(t))^2

Normált Hamming távolság:  a(t)=1-\frac{D(t)}{N} .

Ha  lim_{t \rightarrow \infty } a(t) \rightarrow 1 információvesztés történik, nem nyerhető vissza a kezdőállapot, ha kisebb mint 1, a rendszer "emlékszik", hogy a két különböző kezdeti állapot eltér.

Két egymás közeléből indított trajektória távolsága:  D(t)\simeq D(0) e^{\lambda t} , ahol \lambda a Lyapunov exponens. Ha  \lambda > 0 a rendszer kaotikus, ha kisebb mint 0, befagyott, ha 0, kritikus állapotban.

N(csúcsok száma)-K(kontroll elemek, bejövő élek száma egy csúcsban) modellben D(t+1)=\frac{K}{2}D(t), így  D(t)=\left( \frac{K}{2} \right) ^t D(0)=D(0)e^{t ln(K/2)} . Így K > 2 állapot kaotikus, K < 2 befagyott, és K=2 kritikus.

Spinüvegek

Közismert, hogyha mágneses momentumokat (spineket) akarunk elhelyezni egy háromszögrácson, antiferromágneses csatolás mellett, akkor az frusztrált lesz: például egy háromszög két csúcsára leteszünk ellenkező beállással 1-1 spint, akkor a harmadiknak nincs optimális beállása.

A spinüvegekben hasonló frusztrációk vannak, rendezetlen rácson. Úgy lehet elképzelni, hogy a spinek véletlenszerű helyeken, véletlenszerű (ferro- vagy antiferromágneses) kölcsönhatásokkal vannak összekötve. Ennek eredményeképpen a külső térre adott válaszuk igen bonyolult, számos különböző időskálán zajlik. A leírásuk is igen nehézkes. Az egyetlen anailitikus megoldással rendelkező modellben (Sherrington-Kirkpatrick) a spinek között a szokásos Hamilton írja le a kölcsönhatást:

\mathcal{H} = -\sum_{i\ne j} J_{ij}S_i S_j - \sum_{i}h_iS_i

de J_{ij} egy véletlen valószínűségi változó Gauss-eloszlással, h_i pedig az adott spinre kapcsolt külső tér. Ebben az esetben az átlagos szabadenergia kiszámolható a rendszerre zárt alakban, két fizikailag értelems paraméterrel kifejezve: az egyik paraméter eredő mágnesezettség jellegű, a másik a mágnesezettség szórását jellemzi. A spinüveg helyzetnek az felel meg, amikor az eredő mágnesezettség eltűnik, de a szórás véges, szemben például a ferromágneses renddel, ahol az eredő mágnesezettség nem zérus.

A fázisteret két paraméterrel lehet felmérni: a csatolás relatív szórásával (a fenti Gauss szórása osztva az átlaggal) valamint a csatolás szórásának és a hőmérsékleti energiának (kT) az arányával. Ezen a diagrammon a spinüveg fázis akkor jön létre, amikor a csatolás erősebb a hőmérsékleti fluktuációknál, de a relatív szórása nagy (Megyjegyzés: az ábra vízszintes tengelyén a relatív szórás reciproka van: az átlag osztva a szórással).

SpinGlass.PNG

A rendszerben megfigyelhető egy másodrendű fázisátalakulás a T_c(H=0)-ban, valamint minden alacsonyabb hőmérséklethez is tartozik egy olyan H\neq0 mágneses tér, amelynél a spiüveg fázisból átlépünk az antiferromágneses fázisba. Ezt a H-T térblei vonalat nevezzük Almeida-Thouless vonalnak.

A rendszer érdekessége hogy fázistere erősen "göcsörtös", a spinüveg fázisban az alapállapotok és az alacsonyan fekvő gerjesztett állapotok degeneráltsága magas, így sok különálló fázistérbeli völgy alakul ki. Ennek következtében a kezdőfeltételekben, a külső térben, vagy a hőmérsékletben bekövetkezett infinitezimális változás is eltérő fázistérbeli trajektóriákhoz vezethet (nolám káosz). Bár a hőmérsékleti káoszt még vitatja a szakirodalom.

PhaseSpace.jpg

Markov-lánc, Markov-folyamatok

Egy sztochasztikus folyamatot jellemezhetünk azzal, hogy diszkrét időpillanatokban a tekintett valószínűségi változó milyen értékeket vett fel. Egy rendszert akkor tekintünk leírtnak, ha meg tudjuk mondani minden időpillanatra, minden értékre a megfelelő valószínűségeket:

P_n\left(x_1, t_1, x_2, t_2, ..., x_n, t_n\right)dx_1 dx_2 ... dx_n

ahol n a leírni kívánt lépések száma. Mivel ez egy valószínűség, ezért minden x változójára kiintegrálva 1-et kell kapnunk, ez a norma-feltétel. Ezen felül, ha csak egy x változóra integrálunk, akkor az eggyel kisebb "rendű" valószínűségi kifejezést kell kapnunk:

\int P_n\left(x_1, t_1, x_2, t_2, ..., x_n, t_n\right)dx_1 = P_{n-1}\left(x_2, t_2, ..., x_n, t_n\right)

Tehát ha az egyik mintavételi időpontban minden lehetséges kimenetelre integrálunk, akkor olyan, mintha azt a pontot nem vennénk figyelembe. Ez a kompatibilitási feltétel.

A rendszer jövőbeli állapotainak valószínűségét a korábbi, ismert állapotokból szeretnénk meghatározni. Ennek megfelelően ezt egy feltételes valószínűséggel fogalmazhatjuk meg:

P\left(x_1, t_1|x_2, t_2, ..., x_n, t_n\right)

azaz, ha ismert a rendszer vislkedése t_2, ...., t_n pillanatokban, akkor emellett a feltétel mellett milyen valószínűséggel lesz t_1-ben x_1 állapotban. Egy folyamat akkor Markov-folyamat, ha rendelkezik a Markov-tulajdonsággal, ami azt mondja, hogy a rendszer csak a legutóbbi állpotától függ:

P\left(x_1, t_1|x_2, t_2, ..., x_n, t_n\right) = P\left(x_1, t_1|x_2, t_2\right)

Ebből következik, hogyha 1 pontban ismert a Markov-folyamat, valamint az átmeneti valószínűségek, akkor teljes rendszer ismert, mert rekurzívan minden következő (vagy megelőző) állapot felírható az átmeneti valószínűségekkel:

P_n = w P_{n-1} = w^2 P_{n-2} = ... = w^n P_1(x_n, t_n)\,

Például ha egy diffúziós-folyamatot szeretnénk leírni, akkor az átmeneti valószínűség Gauss:

w(x, t+s|x', t) = \frac{1}{\sqrt{2\pi \sigma^2(x', t) s}} \exp\left(-\frac{(x-x'-v(x', t)s)^2}{2\sigma^2(x', t)s}\right)\,

Homogénnek nevezzük a Markov-folyamatot, ha az átmeneti valószínűég időeltolás-invariáns:

P(x, t|x', t') = P(x, t-t'|x', 0)\,

Homogén diffúziós folyamatokra eben a kontextusban is levezethető a Fokker-Planck-egyenlet, ami lényegében a valószínűség-áramsűrűség megmaradását fejezi ki:

\frac{\partial P(x, t|x')}{\partial t} = -\frac{\partial}{\partial x}\left( v(x)P(x, t|x') \right) + \frac{\partial^2}{\partial x^2}\left( \frac{\sigma^2(x)}{2}P(x, t|x') \right)\,

Brown-mozgás

Esetleg meg lehet említeni/felírni a Brown-mozgást, mint példát diszkrét Markov-folyamatra

Lásd még a Transzportfolyamatok '12 tétel végét.

MSc záróvizsga tételek 2012
Tételek Soktest rendszerek '12 | Transzportfolyamatok '12 | Véletlen gráfok generálása, tulajdonságai '12 | Elsőrendű és folytonos fázisátalakulások '12 | Válasz- és korrelációs függvények, fluktuáció-disszipáció tétel '12 | Sztochasztikus folyamatok '12 | A statisztikus fizikai szimulációk alapjai és a Monte Carlo módszer '12 | Dinamikai rendszerek, kaotikus viselkedés '12 | Adatelemzés: lineáris és nem lineáris regresszió egy modellen bemutatva '12 | Adatelemzés: bootstrap modellek '12 | TCP hálózat működése '12 | Adatelemzés: ARCH, GARCH folyamatok '12 | Numerikus módszerek '12 | Vizualizációs módszerek '12